Filogenia de las plantas
Aquí presentaremos el árbol de la vida de los alimentos utilizando árboles filogenéticos. Esta sección pretende ser complementaria a la vista del esquema del árbol de la vida de las plantas alimenticias, que contiene más información taxonómica sobre las plantas de la que cabe en los árboles y contendrá enlaces a las entradas de nuestro blog sobre las especies de nuestra lista.
Los árboles filogenéticos ilustran las relaciones entre los taxones (un grupo de entidades biológicas en cualquier nivel de la jerarquía taxonómica) y el orden relativo de los eventos de especiación. Antes de hablar de la ubicación de nuestras plantas alimenticias en la filogenia de todas las plantas, proporcionaremos una breve introducción sobre cómo leer los árboles filogenéticos, como estos dos árboles que representan las relaciones entre algunas de las especies alimenticias de la familia Asteraceae (la familia de los girasoles):
Los puntos de ramificación en el árbol se denominan nodos, que representan eventos de especiación, la separación de un grupo de organismos del resto. Los taxones que están conectados por un único punto de ramificación son taxones hermanos. Todos los descendientes de un nodo concreto forman un clado. Cuantos más nodos separen a dos taxones, más alejados estarán. A veces, las ramas del árbol se dibujan a escala para reflejar la edad de los nodos, pero normalmente -y aquí en esta página- no lo están. La longitud de las ramas y la disposición de los nombres de los taxones en las páginas se eligen por comodidad o de forma arbitraria. Así, los dos árboles del ejemplo anterior (Árbol 1 y Árbol 2) representan la misma historia evolutiva. Simplemente, los dos árboles están dibujados de forma diferente.
Filogenia y árboles filogenéticos
La diversidad biológica es el tema de este módulo. Todos los organismos que han existido en este planeta están relacionados con otros organismos en un patrón evolutivo ramificado llamado árbol de la vida. Para descifrar este parentesco entre la diversidad de organismos, tanto vivos como extintos, el «pensamiento arbóreo» es muy valioso. El pensamiento arbóreo, o filogenético, nos ayuda a desentrañar las relaciones evolutivas ramificadas entre las especies existentes, al tiempo que pensamos en el paso del tiempo y en los ancestros de cada una de esas especies vivas. La imagen siguiente representa un árbol filogenético básico, con las especies vivas representadas por letras en la parte superior del diagrama.
Un árbol filogenético es una representación visual de la relación entre diferentes organismos, que muestra el camino a través del tiempo evolutivo desde un ancestro común hasta los diferentes descendientes. Los árboles pueden representar relaciones que van desde toda la historia de la vida en la Tierra hasta los individuos de una población. Los árboles que muestran las especies nos ayudan a entender cómo se forman nuevas especies a partir de especies ancestrales comunes. El proceso de formación de nuevas especies, llamado especiación, es el punto de partida de un debate sobre la diversidad biológica. El punto final natural será la extinción.
Cómo analizar el árbol filogenético
Desde una perspectiva evolutiva se ha propuesto que la familia de TFs AINTEGUMENTA (ANT) se conserva como parte del conjunto de herramientas moleculares ancestrales que permitieron la vida y el desarrollo de las plantas en la Tierra (Kim et al., 2006; Shigyo et al., 2006; Floyd y Bowman, 2007). Anteriormente, se planteaba la hipótesis de que el ancestro común de los musgos y las plantas vasculares codificaba dos genes ANT que posteriormente se diversificaron en las plantas con semillas (Floyd y Bowman, 2007). Sin embargo, las secuencias de algas y briofitas estaban poco representadas o no aparecían en los análisis filogenéticos anteriores (Kim et al., 2006; Shigyo et al., 2006; Floyd y Bowman, 2007) y no está claro si el origen de los subclados basalANT y euANT fue anterior a la divergencia de las plantas terrestres.
En el caso de A. thaliana ANT, se ha demostrado que el TF ANT juega un papel clave en el desarrollo de la flor (Krizek, 1999). La OE de ANT bajo el promotor constitutivo 35S del virus del mosaico de la coliflor (35S::ANT) provoca el desarrollo de órganos florales más grandes como resultado de un aumento del número de células en los sépalos. Mientras que los pétalos, estambres y carpelos más grandes observados en las plantas con OE de ANT son el resultado de un aumento del tamaño de las células.
Cladograma
Un árbol filogenético basado en los genes de ARNr,[cita requerida] que muestra los tres dominios de la vida: bacterias, arqueas y eucariotas. La rama negra en la parte inferior del árbol filogenético conecta las tres ramas de organismos vivos con el último ancestro común universal. En ausencia de un grupo externo, la raíz es especulativa.
Un árbol filogenético (también filogenia o árbol evolutivo [3]) es un diagrama de ramificación o un árbol que muestra las relaciones evolutivas entre varias especies biológicas u otras entidades basadas en las similitudes y diferencias de sus características físicas o genéticas. Toda la vida en la Tierra forma parte de un único árbol filogenético, lo que indica una ascendencia común.
En un árbol filogenético enraizado, cada nodo con descendientes representa el ancestro común más reciente inferido de esos descendientes,[cita requerida] y las longitudes de las aristas en algunos árboles pueden interpretarse como estimaciones temporales. Cada nodo se denomina unidad taxonómica. Los nodos internos suelen llamarse unidades taxonómicas hipotéticas, ya que no pueden observarse directamente. Los árboles son útiles en campos de la biología como la bioinformática, la sistemática y la filogenética. Los árboles sin raíz sólo ilustran el parentesco de los nodos de las hojas y no requieren que se conozca o infiera la raíz ancestral.